生物安全柜是為操作原代培養物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時，用來保護操作者本人、實驗室環境以及實驗材料，使其避免暴露于上述操作過程中可能產生的感染性氣溶膠和濺出物而設計的.事實上，生物安全柜更側重于保護操作人員和環境，防止操作的病原微生物擴散造成人員傷害和環境污染。
生物安全柜的排風系統中裝有空氣過濾器，它能有效地截留所有已知傳染因子，對于直徑0.3μm的顆粒它可以截留99.97%，對大于或小于直徑0.3μm的顆粒它可以截留99.99%，并確保從安全柜中排出的是不含微生物的空氣。因此正確使用安全柜可以有效地減少由于氣溶膠暴露或濺出物所造成的實驗室污染以及培養物等交叉污染，減少對環境和人身安全所造成的危害，有效地保護實驗室人員的健康與安全，減少職業暴露的發生。
1、每次檢驗操作后用75%的酒精(其他殺菌劑視用戶使用的材料而定)*對安全柜內部工作區域表面、側壁、后壁、窗戶進行表面凈化。切勿使用含有氯的殺菌劑，因為它可能對安全柜的不銹鋼結構造成損壞。同時對紫外燈和電源輸出口表面進行清潔。當清潔安全柜內部區域時，操作人員除了手放以外，身體的其他任何部位不能進入安全柜。
2、長時間未實驗時也得每兩周進行清潔維護，按5.1進行，定期清潔不銹鋼表面會使之保持表面的光滑美觀。
3、每月用濕布對安全柜外部表面進行擦拭，尤其是安全柜的前面和上部，把堆積的灰塵打掃干凈。并檢查所有的維護配件的合理使用情況。
4、根據實際情況，每個季度或者半年檢查安全柜的任何物理異常或故障，如有異常及時報修;將初效過濾器拆下清洗，防止積塵將導致進風量不足，而降低潔凈效果。
5、每年請具備資格的認證技術人員對生物安全柜進行性能認證，依據紫外燈使用壽命效果，進行紫外燈的更換;當正常調節或清洗初效空氣過濾器后，仍達不到理想的截面風速時，則應調節風機的工作電壓(旋動旋鈕)，從而達到理想的均勻風速(將調節風速旋鈕從左向右，從低速向高速緩慢調節，新工作臺不應調至高風速)。
6、在使用十八個月后當風機工作電壓調整至高點時，仍不能達到理想風速時，則說明空氣過濾器積塵過多(濾料上濾孔已基本被堵，要及時更新)，一般空氣過濾器的使用期限為十八個月;更換空氣過濾器時，應注意型號規格尺寸(原生產廠家配置)，按箭頭風向裝置，并注意過濾器的周邊密封，無滲漏現象發生。
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